犬最常遇到的胃肠毛病，包括：反胃（Regurgitation ）、慢性呕吐（Chronic Vomiting）以及慢性腹泻（Chronic Diarrhoea ）。 反胃源自食道毛病 犬反胃和呕吐主要是由食道的毛病引致，这些毛病包括食道的运动不足 （Hypomotility）、食道内有阻碍物（Obstruction ）、炎症（Inflammation）以及生瘤（Neoplasia ）。而食道的毛病一般可从胸廓的放射照片（Thoracic radiographs）和内窥镜检查（Endoscopy ）得知病情。
慢性呕吐与慢性腹泻 慢性呕吐的成因有以下六类：
（一）食物中毒、食物过敏症等；
（二） 肠道的寄生物；
（三）胃部能动性的毛病；
（四）胃溃疡或胃炎；
（五）胃肠有 阻碍物如有赘瘤形成；
（六）炎症的大肠毛病。
要治疗宠物的慢性呕吐，主人必须注意宠物的饮食和及时带牠们去看医生。目前医学畀已掌握了有效的诊断方法，Cisapride 和Erythromycin更是治疗这种毛病的有效药物。
通常导致宠物慢性腹泻离不开下列几种原因：
（一）宠物对食物产生异常反应；
（二）病原体的发作；
（三）寄生物；
（四）肠道细菌过度生长（Small Intestinal Bacterial Overgrowth SIBO）；
（五）炎症的大肠毛病（Inflammatory Bowel Diseases）（IBD ）；
（六）胃肠道的阻碍物；
（七）过敏的大肠综合症 状（Irritable Bowel Syndrome IBS）；
（八）狗只外分泌的胰腺不足；
（九）猫只的甲状腺机能亢进等。
治疗慢性腹泻的方法包括：使肠道的细菌生长情况回复正常；控制IBD 减低炎症的机会；恢复肠道的功能，并且确保营养素能够被身体所吸收。